本博连读的学制普遍为七年，其特点是本科、硕士研究生、博士研究生阶段衔接连贯，无间隔。

以协和医学院的本硕博连读（八年制）为例，其分为四个阶段：第一阶段，医学预科阶段，时长五个学期，于清华大学生物系进行。第二阶段，基础医学阶段，时长三个学期，在校本部基础医学院学习。第三阶段，临床医学阶段，包括见习，时长四个学期，在校本部临床医学院进行。第四阶段，临床实习与科研训练，时长四个学期，其中毕业前8个月为科研训练时间，学生需在博士生导师指导下，独立完成科研项目并通过答辩。

在2009年，哈尔滨工业大学参照斯坦福大学等世界知名高校的课程设置，对约百名“尖子生”实施“本硕博连读”培养计划。该计划允许学生同时获得哈尔滨工业大学以及国外高校的毕业证书和学位证书，体现出高等教育的国际化趋势与高标准要求。