西南交通大学拥有丰富多样的专业设置，涵盖了工程、理科、经济、管理、人文、艺术和交通运输等多个领域。以下是部分主要学院及其专业：

计算机科学与通信工程学院：

计算机科学与技术

通信工程

自动化

软件工程

信息安全

电子科学与技术（微电子技术）

计算机科学与技术（网络工程）

电气工程学院：

轴状资建电气工程与自动化

电气工程与自动化（城市轨道交通自动化）

电子信息工程

机械工程学院：

机械工程及其自动化

车辆工程

热能与动力工程

仪器仪表类

建筑环境与设备工程

理学院：

数学与应用数学

统计学

信息与计算科学

电子科学与技术

力学系：

工程力学

工程力学（结构分析与软件设计）

生物工程系：

生物工程

交通运输学院：

交通运输

安全工程（交通安全与信息技术）

物流管理

材料工程学院：

材料科学与工程

其他专业，如经济管理、外语、艺术设计、法学等也在学校提供。