甘肃省地质调查院平均工资5666元每月。根据查询相关公开信息：甘肃省地质调查院，正处级事业单位，成立于1999年1月20日，2000年2月以地矿局地质科学研究所为基础组建，开始独立运行，平均工资5666元每月。