厦门大学和福州大学在多个方面存在显著差异。首先，两所大学的地理位置不同。厦门大学坐落于福建省厦门市，而福州大学位于福建省福州市。地理位置上的差异不仅影响了学生的生活环境，也对两校的校园文化和学术氛围产生了影响。

其次，两所大学的成立时间和历史背景也有所不同。厦门大学创建于1921年，最初为私立大学，后改为国立。而福州大学则成立于2002年，是由原先的福州师范专科学校、福建职业大学、福州工艺美术学校、福建体育职业技术学院和福建交通职业技术学院合并而成。历史背景的不同使得两所学校在文化底蕴和传统方面有着各自的特色。

在学科设置和优势专业方面，两所大学也存在较大差异。厦门大学是一所综合性大学，涵盖了哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、医学、管理学和艺术学等多个学科门类。而福州大学则以工科为主，涵盖了工学、管理学、理学、文学、经济学、法学、教育学和艺术学等多个学科门类。这种学科设置上的差异使得两所大学在培养学生的专业技能和知识结构方面有所不同。

此外，两所大学的排名和声誉也有所不同。根据2024年ABC中国大学排名和2024软科中国大学排名，厦门大学分别排名第24名和第24名，而福州大学在这两个排名中分别排名第79名和第89名。排名和声誉的差异反映了两所学校在学术研究、教学质量和社会影响力等方面的差异。

综上所述，厦门大学和福州大学在地理位置、历史背景、学科设置、优势专业、排名和声誉等方面存在明显的区别。这些差异使得两所学校在人才培养、学术研究和社会服务方面各有特点。