四川农业大学和成都理工大学都是国内知名的高等学府，都受到了政府的高度重视。成都理工大学作为一所双一流大学，而四川农业大学则是211工程大学，并且也是双一流大学成员之一。

在2024年的软科中国大学排名中，成都理工大学位于第173名，而四川农业大学则排名146位。在校友会中国大学排名中，成都理工大学位于第138位，而四川农业大学排名105位。从排名来看，四川农业大学在两个榜单上的表现都优于成都理工大学，表明其综合实力更强。

在学科建设方面，成都理工大学拥有10个学科获得C+及以上等级，其中1个学科达到B+级别，2个学科达到B-级别，1个学科为C+，1个学科为C，5个学科为C-。相比之下，四川农业大学则拥有12个学科获得C+及以上等级，其中1个学科达到A-级别，1个学科达到B+级别，5个学科达到B级别，2个学科为B-级别。从学科建设来看，四川农业大学的优势更为明显。

综合来看，四川农业大学在多个方面表现更为出色，尤其是在学科建设和排名上。当然，选择哪所学校还取决于个人的专业兴趣和职业规划，两所学校都有各自的优势和特色。