1931年4月，甘肃大学更名为省立甘肃学院，随后根据教育部指示，将文学系调整为文史系，王德生担任系主任。1938年7月，《修正省立甘肃学院大纲》获得教育部批准。大纲规定，省立甘肃学院设有文史系、教育系和医学专修科，其中文史系实行四年学制，邓春膏担任系主任。

1946年，国立兰州大学筹备委员会成立。同年7月15日，教育部发布文件，批准设立文理、法、医三学院，其中文理学院率先设立了历史系等八个系。1948年7月，经教育部批准，兰州大学文理学院正式分设为文学院和理学院，文学院下设中国文学、历史学、英国语言文学、俄文及边疆语文五个系。

1959年，甘肃省教育厅批准将兰州大学中文系和历史系并入甘肃师范大学和兰州艺术学院。1961年，江隆基出任兰州大学校长，致力于恢复兰州大学的文科系科。同年7月25日，高教部向甘肃省教育厅及兰州大学发出通知，同意兰州大学恢复文科。根据高教部及甘肃省委的意见，兰州大学恢复历史系，设立历史学专业。

2004年2月，兰州大学根据《兰州大学组建学院暂行办法》，在原有的历史系、教育部人文社会科学重点研究基地兰州大学敦煌学研究所及教育部人文社会科学重点研究基地兰州大学西北少数民族研究中心的基础上，成立了兰州大学历史文化学院。2009年11月4日，成立了民族学研究院，作为处级建制。

2024年12月3日，原历史文化学院与民族学研究院合并，组建新的历史文化学院。这一系列调整，不仅反映了兰州大学历史学科的变迁，也体现了其在学术研究和教育上的不断进步。