一、结构不同

1、质子：由两个上夸克和一个下夸克通过胶子在强相互作用下构成。

2、α粒子：由两个中子和两个质子构成（氦-4）。

二、质量不同

1、质子：质量是938百万电子伏特/c²(MeV/c²)，即1.672621637（83）×10⁻²⁷千克，大约是电子质量的1836.5倍（电子的质量为9.10938215（45）×10⁻³¹千克），质子比中子稍轻（中子的质量为1.674927211（84）×10-27千克）。

2、α粒子：质量为氢原子的4倍。

三、特点不同

1、质子：原子核中质子数目决定其元素的种类和它属于何种化学元素。

2、α粒子：速度每秒可达两万公里，带正电荷；穿透力不大，能伤害动物的皮肤。