教育部四轮学科评估中，“控制科学与工程”一级学科共有115所高校的学科上榜。

A+：清华大学、 哈尔滨工业大学 、浙江大学

A：北京航空航天大学 、北京理工大学、 东北大学、 上海交通大学、 国防科技大学

A-：哈尔滨工程大学、 东南大学、 山东大学 、华中科技大学、 中南大学 、西安交通大学 、广东工业大学、 火箭军工程大学

另有，全国第四轮学科评估——科研单位评估结果中：中国科学院大学“控制科学与工程”获评“A”学科。控制科学与工程(自动化)学科实力较强的大学主要集中在老牌的工科院校，也有不少普本高校的自动化水平靠前，如，杭州电子科技大学、 燕山大学 、江苏大学、 浙江工业大学、 山东科技大学等。