抗虫棉主要运用了转基因技术。这种技术主要通过两种机制来抵抗害虫：形态抗性和生理生化抗性。形态抗性涉及棉叶无蜜腺、茎叶多茸毛、光滑茎叶和鸡脚叶等特异形态结构，这些结构会干扰害虫的取食、消化和产卵等活动。生理生化抗性则是指棉株内存在的特异代谢产物，如棉毒素、单宁和类黄酮等，这些成分对害虫的行为、营养、代谢、生长和生殖产生抑制作用。

1. 抗虫棉主要防控棉铃虫，这种害虫对棉花的蕾铃期造成严重危害，主要攻击枝条嫩尖、嫩叶和幼蕾，导致棉蕾脱落，进而影响棉花的正常发育和产量。

2. 尽管抗虫棉对棉铃虫有较好的防控效果，但它并不完全免疫于其他害虫，如蚜虫和棉叶螨。因此，在棉田发生这些其他害虫时，仍需进行及时防治。在正常情况下，抗虫棉可以显著减轻棉铃虫对蕾铃的危害，减少约80%的损害，并且防治阈值较非抗虫棉高，通常不需要额外防治。然而，在棉铃虫大量爆发的情况下，当害虫数量超过抗虫棉的防治阈值时，就必须采取辅助防治措施。

抗虫棉的种类包括转基因单价抗虫棉和转基因双价抗虫棉。转基因单价抗虫棉通过改造一种来自细菌的Bt杀虫蛋白基因，使其在棉花细胞中表达，这种杀虫蛋白专门破坏棉铃虫等鳞翅目害虫的消化系统，导致害虫死亡。通常情况下，这种蛋白对人畜无害。