中世纪被称为黑暗时代，源自其社会、政治、经济、文化和卫生状况的全面落后。政权的分裂和统一的缺失导致了战争频发，使得人民生活在动荡不安中，苦不堪言。在黑暗时代，政治权力被教会和教皇所掌握，他们以神权统治整个欧洲，推行愚民政策，压制科学思想的发展，剥夺了民众对知识的渴望。宗教斗争主导了政治格局，对人性的压迫和对思想的禁锢，使得黑暗时代成为一场对人类精神的摧残。

中世纪的卫生环境极其恶劣，人们对于排泄物的处理极为粗放，导致疾病的传播。贵族和普通民众的生活条件相差悬殊，贵族们虽然穿得华丽，但排泄方式原始，平民百姓则在街边随意排泄。这种卫生环境为疾病如黑死病的爆发提供了温床。医学条件落后，医生们依赖古希腊理论进行治疗，以放血等手段试图清除所谓的“不干净”，结果导致许多无辜者的死亡。医学实践与宗教信仰交织，使得人类在面对疾病时，更多地寄希望于神的旨意而非科学与理性。

在黑暗时代，知识分子和学者也遭受着迫害。科学发现和理性思考被视为对教会权威的挑战，科学家们因为提出与传统观念相左的见解，遭受了残忍的惩罚。例如，因提出血液循环理论而被烧死的科学家，以及因解剖学研究而被逼至圣地忏悔的生物学家，都成为了黑暗时代残酷迫害的牺牲品。女性更是成为了迫害的主要对象，她们因为知识水平有限，在宗教环境中被误解，稍有偏差就被贴上“巫师”的标签，遭受无端的迫害和折磨。

综上所述，中世纪黑暗时代之所以被称为“黑暗”，在于其政权的分裂、宗教的压迫、卫生环境的恶劣、医学的落后以及对知识分子的迫害。这些因素共同作用，使得社会陷入了长期的动荡和黑暗之中。然而，随着时间的推移，随着人文主义思想的复兴，中世纪的黑暗终将被光明所取代，人类社会步入了新的发展阶段。