新疆有众多知名的高等教育机构，以下是其中一些主要的大学：

1. 新疆大学：位于乌鲁木齐市，是自治区创办最早、规模最大的综合性大学，设有多个学院和研究院，涵盖了理、工、文、法、经、管、教育、艺术等学科。

2. 石河子大学：位于石河子市，是一所以工为主，工、农、理、文、管、经济、教育、艺术多学科协调发展的全日制本专科高校。

3. 塔里木大学：位于阿拉尔市，以农林科学为主，是服务于新疆农业现代化和南疆地区经济社会发展的重要基地。

4. 新疆师范大学：主要培养教育类专业人才，是自治区重点建设的师范教育基地。

5. 新疆财经大学：专注于经济、管理类教育，为新疆的经济发展输送了大量专业人才。

6. 昌吉学院：位于昌吉市，是一所本科层次的普通高校，涵盖工、管、文、理、教育、艺术等学科。

7. 兵团工程大学：隶属于新疆生产建设兵团，是一所以工科为主，工、管、文、理、经、法、教育、艺术等多学科协调发展的军事工程大学。

8. 伊犁师范大学：位于伊宁市，是培养基础教育师资和应用型人才的高校。

以上只是新疆部分大学的列举，实际上新疆还有新疆医科大学、新疆农业大学、新疆艺术学院等多所知名学府。这些大学不仅在本地区享有较高声誉，也在全国范围内有一定的影响力。