根据文章内容，对于广州二中和广州二中应元学校的选择，似乎应元学校在平均分数和校风方面占据优势。应元学校的历年中信老考成绩通常非常出色，A级升学率极高，基本保证了进入重点高中的机会。师资力量和管理风格也被提及为温馨且开明，学生素质普遍较高。然而，应元学校的学费较高，每年1.5万元，且招生可能与校长关系有关。

另一方面，广州二中本部虽然规模较塌坦念小，但整体教育质量不容忽视。近年来，二中萝岗高中校区开设了苏元学校，性质类似应元，但学费较低，为3年4.5万元。苏元学校风景优美，但学生数量较少，尚处于发展阶段。如果对环境和人数有较高要求，苏元学校可能是个不错的选择。

因此，选择哪所学校主要取决于你的预算、对学术成绩的重视程度以及对校园环境的需求。应元学校在成绩上有明显优势，但费用较高；而萝岗校区的苏元团困学校则提供了一个平衡学费和环境的机会。建议根据自身情况和实际需求进行权衡。