来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件 (黒の组织から来た女 大学教授杀人事件) 1999/01/04 2小时特别篇

130 竞技场无差别胁迫事件(前篇) (竞技场无差别胁迫事件（前编）) 1999/01/11

131 竞技场无差别胁迫事件(后篇) (竞技场无差别胁迫事件（后编）) 1999/01/18

135 消失的凶器搜索事件 (消えた凶器捜索事件) 1999/02/15 动画原创

136 青色古堡探索事件(前篇) (青の古城探索事件（前编）) 1999/02/22

137 青色古堡探索事件(后篇) (青の古城探索事件（后编）) 1999/03/01

138 最后上映的杀人事件(前篇) (最后の上映杀人事件（前编）) 1999/03/08

139 最后上映的杀人事件(后篇) (最后の上映杀人事件（后编）) 1999/03/15

140 SOS！步美传达的讯息 (SOS!歩美からのメッセージ) 1999/04/12 动画原创

146 本厅刑事恋爱物语(前篇) (本庁の刑事恋物语（前编）) 1999/05/24

147 本厅刑事恋爱物语(后篇) (本庁の刑事恋物语（后编）) 1999/05/31

156 本厅刑事恋爱物语Ⅱ(前篇) (本庁の刑事恋物语2（前编）) 1999/08/09

157 本厅刑事恋爱物语Ⅱ(后篇) (本庁の刑事恋物语2（后编）) 1999/08/16

174 20年的杀意，新佛尼号连续杀人事件 (20年目の杀意 シンフォニー号连続杀人事件) 2000/01/03 2小时特别篇（出场约10秒……）

176 与黑暗组织的再会(灰原篇) (黒の组织との再会（灰原编）) 2000/01/17

177 与黑暗组织的再会(柯南篇) (黒の组织との再会（コナン编）) 2000/01/24

178 与黑暗组织的再会(解决篇) (黒の组织との再会（解决编）) 2000/01/31

182 九门大搜索 (大捜索9つのドア) 2000/02/28 动画原创

188 危命的复活 洞窟中的侦探团 (命がけの复活～洞窟の探侦団) 2000/05/01

189 危命的复活 负伤的名侦探 (命がけの复活～负伤した名探侦) 2000/05/08

190 危命的复活 第三种选择 (命がけの复活～第三の选択) 2000/05/15

191 危命的复活 黑衣骑士 (命がけの复活～黒衣の骑士) 2000/05/22

192 危命的复活 新一回来了 (命がけの复活～帰ってきた新一) 2000/05/29

193 危命的复活 约定的场所 (命がけの复活～约束の场所) 2000/06/05

194 意味深长的八音盒(前篇) (意味深なオルゴール（前编）) 2000/06/12

195 意味深长的八音盒(后篇) (意味深なオルゴール（后编）) 2000/06/19

205 本厅刑事恋爱物语Ⅲ(前篇) (本庁の刑事恋物语3（前编）) 2000/08/28

206 本厅刑事恋爱物语Ⅲ(后篇) (本庁の刑事恋物语3（后编）) 2000/09/04

212 蘑菇、山熊和侦探队(前篇) (きのこと熊と探侦団（前编）) 2000/11/06

213 蘑菇、山熊和侦探队(后篇) (きのこと熊と探侦団（后编）) 2000/11/13

225 生意兴隆的秘密 (商売繁盛のヒミツ) 2001/02/19 动画原创

230 迷一样的乘客(前篇) (谜めいた乗客（前编）) 2001/04/16

231 迷一样的乘客(后篇) (谜めいた乗客（后编）) 2001/04/23

233 无法消失的证据(前篇) (消えなかった证拠（前编）) 2001/05/14

234 无法消失的证据(后篇) (消えなかった证拠（后编）) 2001/05/21

242 元太的灾难 (元太少年の灾难) 2001/07/16

246 陷入网中的谜团(前篇) (网にかかった谜（前编）) 2001/08/13

247 陷入网中的谜团(后篇) (网にかかった谜（后编）) 2001/08/20

258 来自芝加哥的男人(前篇) (シカゴから来た男（前编）) 2001/11/19

259 来自芝加哥的男人(后篇) (シカゴから来た男（后编）) 2001/11/26

266 情人节的真相(事件篇) (バレンタインの真実（事件编）) 2002/01/28

269 犯罪的纪念品(前篇) (犯罪の忘れ形见（前编）) 2002/02/18