here you are有两重意思：

1.here you are 是祈使句，是给你或者说你要的东西在这里的意思。

2.而here are you 则是You are here 的倒装句。表示的意思是你在这里。

适用场景如下：

A：May I have a look at it？ 可以让我看看吗？

B：Here you are. 给你。

祈使句肯定结构：

1.Do型(即：动词原形(+宾语)+其它成分)。如：Please have a seat here. 请这边坐。

有的祈使句在意思明确的情况下，动词可省略。如：This way,please. = Go this way,please. 请这边走。

2.Be型(即：Be +表语(名词或形容词)+其它成分)。如：Be a good child! 要做一个好孩子!

3.Let型(即：Let + 宾语 + 动词原形 + 其它成分)。如：Let me help you. 让我来帮你。