甘南海拔排名从高到低依次为：玛曲县、碌曲县、夏河县、临潭县和卓尼县、迭部县、舟曲县。

玛曲县位于甘南藏族自治州的最西北部，靠近青海省，是甘南地区海拔最高的县份。其平均海拔超过4000米，部分地区的海拔甚至更高，这使得玛曲县的自然景观独特而壮观，拥有广袤的草原和壮丽的雪山。

碌曲县位于玛曲县的东南部，与四川省接壤，其平均海拔也相对较高，接近4000米。这里的地势同样复杂多样，既有高山草甸，也有峡谷河流，为游客提供了丰富的自然风光体验。

夏河县则位于碌曲县的东南部，与青海省相邻，其平均海拔略低于碌曲县，约为3500米。夏河县是甘南地区的重要旅游目的地之一，拥有众多著名的文化遗址和自然景观，如拉卜楞寺等。

临潭县和卓尼县位于甘南藏族自治州的中部，两县的平均海拔介于夏河县和迭部县之间，大约为3000米。这两个县同样拥有丰富的自然资源和人文景观，是游客探索甘南不可错过的地方。

迭部县位于甘南藏族自治州的最南端，与四川省接壤，是甘南地区海拔相对较低的县份之一。其平均海拔为2500米左右，这里的地貌以山地为主，气候较为温和，适合开展多种户外活动和休闲旅游。

舟曲县位于甘南藏族自治州的最东部，与陕西省相邻，是全州海拔最低的县份。其平均海拔为1500米左右，这里的地形以丘陵和山地为主，气候湿润，生态环境良好，是甘南地区的重要生态屏障。

综上所述，甘南藏族自治州的各县份海拔差异明显，从高到低依次为玛曲县、碌曲县、夏河县、临潭县和卓尼县、迭部县、舟曲县。这种地形地貌的多样性不仅造就了甘南独特的自然风光和人文景观，也为游客提供了丰富多样的旅游体验。