微生物实验室的设计规划有着严格的要求，需要合理规划出各个功能区域，例如准备室、微生物培养室、器械消毒及清洗室、纯水室、检测室、菌种室、储藏室等。

各个功能区域应当独立，通过设置隔离门来划分。重要实验室应设立缓冲区，人员进入实验室前需在缓冲区进行二次清洁及更换衣物。

实验室及其缓冲间的围护结构内表面应当光滑、耐腐蚀、防水，便于消毒和清洁。所有缝隙需密封，确保无渗漏。实验室内的所有门应能自动关闭。

除观察窗外，不得设置任何窗户。观察窗需密封，使用不碎玻璃。地面应无渗漏，光洁但不滑。避免使用地砖和水磨石等有缝隙的地面材料。

实验室的通风空调系统必须为直排系统，不得采用部分回风系统，确保空气流通顺畅，减少交叉污染。

实验室中的家具需坚固耐用。为了便于清洁，各种家具和设备之间应保持适当间距。应设有专门放置生物废弃物的容器台或架。家具和设备的边角和突出部位应光滑无毛刺，以圆弧形为佳。

实验室内部布局需考虑人流和物流的合理流动，减少交叉污染的风险。此外，实验室内的照明需充足，便于观察和操作。

微生物实验室的特殊要求还包括配备高效过滤系统，确保空气质量和生物安全。在实验室进出口处应设有洗手池和消毒设施，确保人员进入和离开实验室时的卫生安全。

实验室的清洁消毒工作需定期进行，包括对桌面、仪器设备和地面的清洁和消毒。此外，还需定期检查实验室的通风系统和空调系统，确保其正常运行。