马鞍山总共有三所本科院校，分别是安徽工业大学、马鞍山学院、皖江工学院。其中安徽工业大学是老牌的本科院校。另外两所系根据教育部《关于加快推进独立学院转设工作的实施方案》的规定，转设而来，而且现在二本三本是联合招生，所以基本上来说只存在一本、二本院校，三本的说法已经成为历史了。

安徽工业大学，安徽省属一本院校。学校始于1958年创建的马鞍山钢铁工业学校，1978年升格为马鞍山钢铁学院，是华东地区钢铁行业唯一一所本科院校，1985年更名华东冶金学院，隶属冶金工业部；1998年划转安徽省，实行“中央与地方共建，以安徽省管理为主”的管理体制；2000年与安徽商业高等专科学校合并组建安徽工业大学

马鞍山学院，原安徽工业大学商学院。学校的前身，是2003年6月成立的安徽工业大学工商学院，是安徽工业大学申办，经教育部和安徽省人民政府批准设立的独立学院。2024年12月，安徽工业大学与深圳市赛为智能股份有限公司合作举办安徽工业大学工商学院。2024年6月，经教育部批准，转设为马鞍山学院。

皖江工学院。学校前身为河海大学与江苏大业投资有限公司、无锡市大业房屋建设开发有限公司合作举办的独立学院——河海大学文天学院，2008年5月7日经教育部批准设立，2024年顺利通过学士学位授予权评审，被批准为学士学位授予单位。2024年学校经国家教育部评审，成功转设为独立设置的民办本科学校，更名为皖江工学院