微电子：是随着集成电路，尤其是超大型规模集成电路而发展起来的一门新的技术。其发展的理论基础是19世纪末到20世纪30年代期间建立起来的现代物理学。

物理电子：是电子学、近代物理学、光电子学、量子电子学、超导电子学及相关技术的交叉学科，主要在电子工程和信息科学技术领域内进行基础和应用研究。学科着重研究在强辐照、低信噪比、高通道密度等极端条件下，处理小时间尺度信号的技术，以及这些技术在广泛领域内的应用前景。

这两门学科比较相似，但是他们不属于一个系别。微电子有一部分研究方向是需要物理电子的基础的。比如微电子的器件，工艺方向。很多物理电子的考研也是需要用微电子的。