福建工程学院鳝溪分校与本部校区之间的差异并不明显。现今大学设立多个校区的情况屡见不鲜。

专业分布于不同校区乃是一种常规安排。各校区间可能因建设年代的差异，导致住宿条件存在不同。

鳝溪校区与本部校区在整体教学、设施和资源方面并无显著差异。专业设置的差异，让不同校区各具特色，以适应多元化的教育需求。

由于校区分布，某些专业的学生可能会在特定校区进行学习。不同校区之间的设施与服务可能根据其定位和目标学生群体有所调整。

值得注意的是，虽然鳝溪校区与本部校区在硬件设施上可能有细微差异，但两校区在学术资源、师资力量以及教学活动等方面保持一致。这样的布局旨在满足不同学生的学习需求，以及充分利用教育资源。