武汉工程大学的两个校区，即流芳校区与武昌校区，各有特色与差异。

流芳校区位于武汉东湖新技术开发区光谷一路206号，而武昌校区则坐落于武汉市洪山区雄楚大道693号。流芳校区的人数明显多于武昌校区，且武昌校区仅设有资源与安全学院、土木工程与建筑学院两个院系，其余院系则在流芳校区。

武汉工程大学作为湖北省重点建设高校、湖北省国内一流学科建设高校，以工为主，涵盖工、理、管、文、法、艺术、医学、教育学等九大学科门类，是一所多科性教学研究型大学。

学校下设17个二级学院和1个部，开设69个专业进行招生，拥有1个博士后科研流动站和1个博士后科研工作站。

在学科建设上，截至2024年6月，化学、材料科学和工程学三个学科进入ESI全球前1%，展现出学校在科学研究和学术领域的卓越成就。