黄梅县的高等教育机构包括湖北理工学院滨江学院和中国科学院大学。湖北理工学院滨江学院是由湖北理工学院和黄梅县人民政府联合创办的，旨在推动黄梅和湖北小池滨江新区的社会经济发展，助力湖北理工学院参与地方经济建设，实现转型与提升科技成果应用水平。与此同时，中国科学院大学在黄梅设有研究机构，专注于高能核物理理论等领域的研究。