从多个角度来看，闽南师范大学在办学质量上更胜一筹。首先，闽南师范大学作为一本院校，拥有更悠久的办学历史和丰富的教学经验。相比之下，厦门理工学院在本科招生阶段，厦门理工学院的名字还叫鹭江职业大学，直到改名为厦门理工学院并进入本科招生阶段，而此时闽南师范大学已经是一所知名的一本高校。

厦门理工学院虽然近几年的教学水平有所提升，但在福建这样的老牌高等教育省份中，与闽南师范大学相比仍然存在一定的差距。当然，厦门理工学院的汽车工程专业在省内确实属于顶尖水平，具有较强的竞争力。

此外，从全国排名来看，闽南师范大学在全国大学排名中比厦门理工学院高出一百多名，这也从一个侧面反映了两校在整体教学质量和学术研究方面的差异。

总的来说，无论是从历史背景、教学水平还是全国排名来看，闽南师范大学都优于厦门理工学院。当然，这并不意味着厦门理工学院没有优势，它在某些特定领域，如汽车工程专业，具备很强的实力和竞争力。