●外显子就是在成熟mRNA中保留下的部分，也就是说成熟mRNA对应于基因中的部分。

●内含子是指在mRNA加工过程中被剪切掉的部分，在成熟mRNA中不存在的部分。

二者都是对于基因而言的，编码的部分为外显子，不编码的为内含子，内含子没有遗传效应。

所谓mRNA就是信使mRNA，是将来可以翻译成蛋白质的一种核糖核酸。生物体的各种表型效应都是由于基因的最终产物蛋白质引起的。

虽然以前认为内含子是没有什么功能的，但现在的研究认为内含子可能有一定的功能，比如在mRNA加工过程中起帮助作用、可能对机体有一定的调控作用，并且内含子只是对一个特定的基因而言是它的内含子，此内含子对于其它的基因而言，也有可能是外显子或者外显子的一部分。