真核细胞的细胞质中，除去可分辨的细胞器以外的胶状物质，称为细胞质基质。其组成成分有水，蛋白质，酶（包括蛋白质酶以及核酶），细胞质骨架，糖原，脂滴等。其主要功能如下：

1.蛋白质的修饰，如蛋白质磷酸化与去磷酸化，糖基化作用，酰基化作用，N端甲基化修饰等

2.控制蛋白质的寿命，泛素化是将蛋白质降解的重要标志

3.降解变性和错误折叠的蛋白质，并帮助变性或错误折叠的蛋白质重新折叠，形成正确的构象

4.具有细胞骨架，与维持细胞形态，细胞运动，细胞质内的物质运输，能量传递有关

5.中间代谢的主要场所，如糖酵解过程