HXD3C型机车是在2009年机车直供DC600V25G型客车大面积生产应用的背景下应急设计的电力机车，由于时间仓促直接采用了HXD3B型电力机车的车体和HXD3型电力机车的内部系统元件和转向架，再添加了DC600V机车直接供电设备而设计完成的。而HXD3型机车和HXD3B型机车都是货运型机车，再加上HXD3C型机车调级手柄只有7级以及牵引功率大等原因，因此牵引旅客列车启动、制动和调速时容易产生过大的冲动，具体表现为突然的顿挫感和较大的震动,对旅客的乘车舒适性有较大影响，特别是影响夜间旅客的休息,在特殊情况下可能导致乘客因打翻开水、摔倒而受伤。自HXD3C型机车运用以来已多次发生旅客因机车冲动而受伤的事故。因此中国铁路总公司已决议待7200KW大功率准高速客运电力机车（和谐1D型电力机车及和谐3D型电力机车）普及后将所有HXD3C型机车转为货运以彻底解决此类问题 。